このノートブック例では、Databricks で機械学習分類モデルをトレーニングする方法を示します。 Databricks Runtime for Machine Learningには、トレーニングアルゴリズムと前処理アルゴリズム用の scikit-learn、モデル開発プロセスを追跡するための MLflow、ハイパーパラメーター調整をスケーリングするための Optuna など、多くのライブラリがプレインストールされています。
このノートブックでは、ワインが "高品質" と見なされるかどうかを予測する分類モデルを作成します。 データセットは、さまざまなワインの 11 種類の特徴 (アルコール含有量、酸度、残留糖など) と、1 から 10 の品質ランク付けで構成されます。
このチュートリアルの内容:
- パート 1: MLflow 追跡を使用して分類モデルをトレーニングする
- パート 2: モデルのパフォーマンスを向上させるためのハイパーパラメーターのチューニング
- パート 3: 結果とモデルを Unity カタログに保存する
- パート 4: モデルをデプロイする
モデル ライフサイクル管理やモデル推論など、Databricks での機械学習の運用の詳細については、 ML のエンド ツー エンドの例を参照してください。
データセットは、UCI Machine Learning リポジトリ から入手でき、物理化学的プロパティを用いたデータマイニングによってワインの好みのモデル化 [Cortez et al., 2009]で提供されます。
Requirements
- Databricks Runtime 17.3 LTS ML 以降を実行しているクラスター。 Databricks Runtime 16.4 LTS ML 以下を実行している場合は、「 チュートリアル: Databricks (Hyperopt) で最初の機械学習モデルを構築する」を参照してください。
セットアップ
このセクションでは、次の操作を行います。
- モデル レジストリとして Unity カタログを使用するように MLflow クライアントを構成します。
- モデルを登録するカタログとスキーマを設定します。
- データを読み取り、Unity カタログのテーブルに保存します。
- データを前処理します。
MLflow クライアントの構成
既定では、MLflow Python クライアントは Databricks ワークスペース モデル レジストリにモデルを作成します。 Unity カタログにモデルを保存するには、次のセルに示すように MLflow クライアントを構成します。
import mlflow
mlflow.set_registry_uri("databricks-uc")
次のセルは、モデルが登録されるカタログとスキーマを設定します。 カタログに対する USE CATALOG 権限と、スキーマに対するUSE_SCHEMA、CREATE_TABLE、およびCREATE_MODEL権限が必要です。 必要に応じて、次のセルのカタログ名とスキーマ名を変更します。
詳細については、 Unity カタログのドキュメントを参照してください。
# Specify the catalog and schema to use. You must have USE_CATALOG privilege on the catalog and USE_SCHEMA, CREATE_TABLE, and CREATE_MODEL privileges on the schema.
# Change the catalog and schema here if necessary.
CATALOG_NAME = "main"
SCHEMA_NAME = "default"
データを読み取り、Unity カタログのテーブルに保存する
データセットは、 databricks-datasetsで使用できます。 次のセルでは、 .csv ファイルから Spark DataFrames にデータを読み込みます。 その後、DataFrames を Unity カタログのテーブルに書き込みます。 両方ともデータを保持し、他のユーザーと共有する方法を制御できます。
white_wine = spark.read.csv("/databricks-datasets/wine-quality/winequality-white.csv", sep=';', header=True)
red_wine = spark.read.csv("/databricks-datasets/wine-quality/winequality-red.csv", sep=';', header=True)
# Remove the spaces from the column names
for c in white_wine.columns:
white_wine = white_wine.withColumnRenamed(c, c.replace(" ", "_"))
for c in red_wine.columns:
red_wine = red_wine.withColumnRenamed(c, c.replace(" ", "_"))
# Define table names
red_wine_table = f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.red_wine"
white_wine_table = f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.white_wine"
# Write to tables in Unity Catalog
spark.sql(f"DROP TABLE IF EXISTS {red_wine_table}")
spark.sql(f"DROP TABLE IF EXISTS {white_wine_table}")
white_wine.write.saveAsTable(f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.white_wine")
red_wine.write.saveAsTable(f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.red_wine")
データの前処理
# Import required libraries
import numpy as np
import pandas as pd
import sklearn.datasets
import sklearn.metrics
import sklearn.model_selection
import sklearn.ensemble
import matplotlib.pyplot as plt
import optuna
from mlflow.optuna.storage import MlflowStorage
from mlflow.pyspark.optuna.study import MlflowSparkStudy
# Load data from Unity Catalog as Pandas dataframes
white_wine = spark.read.table(f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.white_wine").toPandas()
red_wine = spark.read.table(f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.red_wine").toPandas()
# Add Boolean fields for red and white wine
white_wine['is_red'] = 0.0
red_wine['is_red'] = 1.0
data_df = pd.concat([white_wine, red_wine], axis=0)
# Define classification labels based on the wine quality
data_labels = data_df['quality'].astype('int') >= 7
data_df = data_df.drop(['quality'], axis=1)
# Split 80/20 train-test
X_train, X_test, y_train, y_test = sklearn.model_selection.train_test_split(
data_df,
data_labels,
test_size=0.2,
random_state=1
)
第 1 部 分類モデルをトレーニングする
# Enable MLflow autologging for this notebook
mlflow.autolog()
次に、MLflow 実行のコンテキスト内で分類子をトレーニングします。これによって、トレーニング済みのモデルと多数の関連するメトリックとパラメーターが自動的にログに記録されます。
テスト データセットのモデルの AUC スコアなどの追加のメトリックでログ記録を補足できます。
with mlflow.start_run(run_name='gradient_boost') as run:
model = sklearn.ensemble.GradientBoostingClassifier(random_state=0)
# Models, parameters, and training metrics are tracked automatically
model.fit(X_train, y_train)
predicted_probs = model.predict_proba(X_test)
roc_auc = sklearn.metrics.roc_auc_score(y_test, predicted_probs[:,1])
roc_curve = sklearn.metrics.RocCurveDisplay.from_estimator(model, X_test, y_test)
# Save the ROC curve plot to a file
roc_curve.figure_.savefig("roc_curve.png")
# The AUC score on test data is not automatically logged, so log it manually
mlflow.log_metric("test_auc", roc_auc)
# Log the ROC curve image file as an artifact
mlflow.log_artifact("roc_curve.png")
print("Test AUC of: {}".format(roc_auc))
MLflow の実行を表示する
ログに記録されたトレーニングの実行を表示するには、ノートブックの右上にある 実験 アイコン [
をクリックして、実験のサイドバーを表示します。 必要に応じて、更新アイコンをクリックして、最新の実行を取得して監視します。
より詳細な MLflow 実験ページを表示するには、実験ページ アイコンをクリックします。 このページでは、実行を比較し、特定の実行の詳細を表示できます。 「MLflow を使用してモデル開発を追跡する」を参照してください。
モデルの読み込み
MLflow API を使用して、特定の実行の結果にアクセスすることもできます。 次のセルのコードは、特定の MLflow 実行でトレーニングされたモデルを読み込み、それを使用して予測を行う方法を示しています。 MLflow 実行ページで特定のモデルを読み込むためのコード スニペットを見つけることもできます。
# After a model has been logged, you can load it in different notebooks or jobs
# mlflow.pyfunc.load_model makes model prediction available under a common API
model_loaded = mlflow.pyfunc.load_model(
'runs:/{run_id}/model'.format(
run_id=run.info.run_id
)
)
predictions_loaded = model_loaded.predict(X_test)
predictions_original = model.predict(X_test)
# The loaded model should match the original
assert(np.array_equal(predictions_loaded, predictions_original))
第 2 部 ハイパーパラメーターの調整
この時点で、単純なモデルをトレーニングし、MLflow 追跡サービスを使用して作業を整理しました。 次に、Optuna を使用して、より高度なチューニングを実行できます。
Optuna を使用した並列トレーニング
Optuna は、ハイパーパラメーター調整用のオープンソース Python ライブラリであり、複数のコンピューティング リソース間で水平方向にスケーリングできます。 Databricks で Optuna を使用する方法の詳細については、「 Optuna を使用したハイパーパラメーターのチューニング」を参照してください。
def objective(trial):
# Enable autologging on each worker
mlflow.autolog()
with mlflow.start_run(nested=True):
params = {
'n_estimators': trial.suggest_int('n_estimators', 20, 1000),
'learning_rate': trial.suggest_float('learning_rate', 0.05, 1.0, log=True),
'max_depth': trial.suggest_int('max_depth', 2, 5),
}
model_hp = sklearn.ensemble.GradientBoostingClassifier(
random_state=0,
**params
)
model_hp.fit(X_train, y_train)
predicted_probs = model_hp.predict_proba(X_test)
# Tune based on the test AUC
# In production, you could use a separate validation set instead
roc_auc = sklearn.metrics.roc_auc_score(y_test, predicted_probs[:,1])
mlflow.log_metric('test_auc', roc_auc)
# Negate the AUC because Optuna minimizes the objective by default
return -roc_auc
with mlflow.start_run(run_name='gb_optuna') as run:
# Use the MLflow Tracking Server as the Optuna storage backend
experiment_id = mlflow.active_run().info.experiment_id
mlflow_storage = MlflowStorage(experiment_id=experiment_id)
# MlflowSparkStudy distributes the tuning using Spark workers
mlflow_study = MlflowSparkStudy(
study_name="gb-optuna-tuning",
storage=mlflow_storage,
)
mlflow_study.optimize(objective, n_trials=32, n_jobs=4)
最適なモデルを取得するための検索実行
すべての実行は MLflow によって追跡されるため、MLflow 検索実行 API を使用して最適な実行のメトリックとパラメーターを取得し、テスト auc が最も高いチューニング実行を見つけることができます。
このチューニングされたモデルは、パート 1 でトレーニングされたより単純なモデルよりも優れたパフォーマンスを発揮する必要があります。
# Sort runs by their test auc. In case of ties, use the most recent run.
best_run = mlflow.search_runs(
order_by=['metrics.test_auc DESC', 'start_time DESC'],
max_results=10,
).iloc[0]
print('Best Run')
print('AUC: {}'.format(best_run["metrics.test_auc"]))
print('Num Estimators: {}'.format(best_run["params.n_estimators"]))
print('Max Depth: {}'.format(best_run["params.max_depth"]))
print('Learning Rate: {}'.format(best_run["params.learning_rate"]))
best_model_pyfunc = mlflow.pyfunc.load_model(
'runs:/{run_id}/model'.format(
run_id=best_run.run_id
)
)
# Make a dataset with all predictions
best_model_predictions = X_test
best_model_predictions["prediction"] = best_model_pyfunc.predict(X_test)
パート 3. 結果とモデルを Unity カタログに保存する
predictions_table = f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.predictions"
spark.sql(f"DROP TABLE IF EXISTS {predictions_table}")
results = spark.createDataFrame(best_model_predictions)
# Write results back to Unity Catalog from Python
results.write.saveAsTable(f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.predictions")
model_uri = 'runs:/{run_id}/model'.format(
run_id=best_run.run_id
)
mlflow.register_model(model_uri, f"{CATALOG_NAME}.{SCHEMA_NAME}.wine_quality_model")
パート 4. モデルのデプロイ
モデルを Unity カタログに保存した後、サービス UI を使用してモデルをデプロイできます。 次の手順では、簡単な説明を示します。 詳細については、「 カスタム モデル サービス エンドポイントの作成」を参照してください。
- サイドバーで [Serving]\( サービス \) をクリックして、サービス UI を表示します。
[ サービス エンドポイントの作成] をクリックします。
[名前] フィールドに、エンドポイントの名前を指定します。
[Served entities]\(提供されるエンティティ\) セクションで、次のようにします。
- [エンティティ] フィールドをクリックして、[Select served entity] (提供されるエンティティの選択) フォームを開きます。
- [ マイ モデル- Unity カタログ] を選択します。 フォームは、選択内容に基づいて動的に更新されます。
-
wine_quality_modelとモデルの選択し、提供するバージョンを指定します。 - サービス済みモデルにルーティングするトラフィックの割合として 100 を選択します。
- この例のコンピューティングの種類として [CPU ] を選択します。
- [ コンピューティング スケールアウト] で、コンピューティング スケールアウト サイズとして [小] を選択します。
Create をクリックしてください。 [ サービス エンドポイント] ページが 表示され、 サービス エンドポイントの状態 が [準備ができていません] と表示されます。
エンドポイントの 準備ができたら、[ 使用 ] を選択して、エンドポイントに推論要求を送信します。